claudia villicaña
María Claudia Villicaña Torres

Investigadora por México – Conahcyt
SNI I

Líneas de investigación: Aislamiento y Caracterización de fagos de bacterias patógenas de importancia en salud y agricultura, Genómica funcional y transcriptómica de microorganismos, Clonación y Caracterización de enzimas codificadas por fagos con potencial biotecnológico, Caracterización Genómica, transcriptómica y funcional de bacterias degradadoras de agroquímicos y con propiedades promotoras del crecimiento en plantas.

Bacteriófagos Bacterias patógenas Profagos Ómicas Enzimas recombinantes AgroquímicosBionoculantes

Google Académico

Coordinación

Ciencia y Tecnología de Productos Agrícolas de Zonas Tropicales y Subtropicales

Teléfono

+52 (667) 480 6950

Correo electrónico

maria.villicana@ciad.mx

Licenciatura en Biología Marina por la Universidad Autónoma de Baja California Sur (2004).

Maestría en Ciencias por el Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S. C. (2007).

Doctorado en Ciencias Bioquímicas por la Universidad Nacional Autónoma de México (2013).

POSGRADO

Alejandro Payán García, Maestría, Caracterización genómica y funcional de bacterias
degradadoras de glifosato y AMPA con potencial en biorremediación (en proceso).

Alexandra Guzmán López, Maestría, Genómica comparativa de cepas de Clavibacter
michiganensis aisladas de México (en proceso).

Lucía Margarita Rubí Rangel, Doctorado, Papel de los bacteriófagos en la biología de Clavibacter
michiganensis (en proceso)

LICENCIATURA

Karla Selena Osuna Flores (en proceso)

Evaluación de la capacidad degradadora de glifosato y ácido aminometilfosfónico (AMPA) de bacterias aisladas de suelo agrícola con potencial en biorremediación. Tesis de Licenciatura. Valeria León Medina. 2023.

Aislamiento y caracterización de bacterias degradadoras de ácido aminometilfosfónico (AMPA) con potencial en biorremediación de suelos  expuestos a glifosato. Tesis de Licenciatura. Brenda Kirey Figueroa Iriarte. 2023.

Aislamiento y caracterización de bacterias degradadoras de glifosato aisladas de suelos agrícolas con potencial en biorremediación. Tesis de Licenciatura. Solangel Itzel Machado Valdez. 2023.

Extracción de proteínas en hojas y raíz de pimiento morrón (Capsicum annuum L.) y su análisis por electroforesis en una y dos dimensiones. Tesis de Licenciatura. René Rodríguez Sepúlveda. 2019.

Evaluación de marcadores moleculares asociados a la resistencia contra Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici en variedades comerciales de tomate. Tesis de Licenciatura. Martín Israel López Valenzuela. 2020

• Miembro de la Sociedad Mexicana de Ciencias Hortícolas (SOMECH) 2023-2024.

• Sistema Nacional de Investigadores Nivel I 2021-2025.

• Evaluador acreditado RCEA-02-37798-2016

• Asesora e Integrante del Directorio de Verano Delfín( desde 2021)

• Divulgador de Ciencia Titular de Red Estatal de Divulgadores de la Ciencia y la Tecnología (RED-C 2023-202

• Miembro honorífico del Sistema Sinaloense de Investigadores y Tecnólogos (SSIT) 2022-2024.

Socio numerario de la Sociedad Mexicana de Biotecnología y Bioingeniería 2021-2022.

Miembro de la American Society of Plant Biologist Section Mexico 2020-2023

– Análisis de los Mecanismos moleculares asociados a la degradación de agroquímicos y plaguicidas.

– Generación de inoculantes microbianos aplicados a procesos de biorremediación y como biofertilizantes.

– Diseño de formulaciones de bacteriófagos como antimicrobianos con aplicación en el área de salud y ciencias agropecuarias.

-Análisis de la diversidad y la Biología de bacteriófagos líticos y temperados aislados de diferentes fuentes ambientales.

– Caracterización de enzimas provenientes de fagos con novedosas aplicaciones biotecnológicas.

1. Salazar-Gutiérez, et al. (2023). Transcriptomic Analysis Reveals the Response Mechanisms of Bell Pepper (Capsicum annuum)

2. Grimaldi-Olivas, et al. (2023). Transcriptomic analysis of bell pepper (Capsicum annuum L.) revealing key mechanisms in response

3. Morales-Merida, et al. (2023) RVE1, DBB1b and COL2 Transcription Factors are Responsive to Combined Stress by UV-B

4. Lafrance, et al. (2023). Response Surface Methodology for Optimization of Multiplex-PCR Protocols for Detection of TYLCV,

5. Martínez-Gallardo, et al. (2023). Current knowledge in the use of bacteriophages to combat infections caused by Pseudomonas

6. Criollo-Mendoza, et al. (2022). Cytotoxic Activity of Polyphenol Extracts from Three Oregano Species: Hedeoma patens, Lippia

7. Lafrance, et al. (2021). Optimization of PCR-based TYLCV molecular markers by response surface methodology. Gene, 785,

8. Morales-Merida, et al. (2021) Transcriptomic analysis of differentially expressed genes in response to combined stress by UV-

9. Amarillas, et al. (2021). The complete genome and comparative analysis of the phage phiC120 infecting multidrug-resistant

10. León-Félix, et al. (2021). The impact of quorum sensing on the modulation of phage-host interactions. Journal of bacteriology,

11. León-Chan, et al. (2020) Differential gene expression of anthocyanin biosynthetic genes under low temperature and ultraviolet-

12. Villicaña, et al. (2019). Occurrence and Abundance of Pathogenic Vibrio Species in Raw Oysters at Retail Seafood Markets

13. Rojas, et al. (2019). Involvement of OpsLTP1 from Opuntia streptacantha in abiotic stress adaptation and lipid metabolism.

14. Rodas-Junco, et al, (2017). Dental Pulp Stem Cells: Current Advances in Isolation, Expansion and Preservation. Tissue Engineering

15. Villicaña, et al. (2016) Antiporter NHX2 is differentially induced in Mesembryanthemum crystallinum natural genetic variant

16. Villicaña, et al. (2014). The basal transcription machinery as a target for cancer therapy. Cancer Cell International, 14(1),

17. Villicaña, et al. (2013). The genetic depletion or the triptolide inhibition of TFIIH in p53-deficient cells induces a JNK-dependent

18. Herrera-Cruz, et al. (2012). Physical and functional interactions between Drosophila homologue of Swc6/p18Hamlet subunit

1. Diseño de un consorcio sintético bacteriano con capacidad degradadora de glifosato y AMPA con
aplicación potencial en procesos de biorremediación

2. Aislamiento y caracterización de bacteriófagos líticos y temperados de Clavibacter michiganensis.

Titular

Biología y Ecología de Bacteriófagos

Biología Celular

Colaborador

Biología Molecular

Técnicas Básicas de Biología Molecular

Evaluación de la expresión génica

Evaluador de solicitudes en convocatorias CONAHCYT

Evaluador de ingreso al SSIT

Revisor en revistas científicas Heliyon, Frontiers in Microbiology, Viruses, Current Issues in Molecular Biology, Microorganisms

Formación profesional

Licenciatura en Biología Marina por la Universidad Autónoma de Baja California Sur (2004).

Maestría en Ciencias por el Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S. C. (2007).

Doctorado en Ciencias Bioquímicas por la Universidad Nacional Autónoma de México (2013).

Dirección de tesis

POSGRADO

Alejandro Payán García, Maestría, Caracterización genómica y funcional de bacterias
degradadoras de glifosato y AMPA con potencial en biorremediación (en proceso).

Alexandra Guzmán López, Maestría, Genómica comparativa de cepas de Clavibacter
michiganensis aisladas de México (en proceso).

Lucía Margarita Rubí Rangel, Doctorado, Papel de los bacteriófagos en la biología de Clavibacter
michiganensis (en proceso)

LICENCIATURA

Karla Selena Osuna Flores (en proceso)

Evaluación de la capacidad degradadora de glifosato y ácido aminometilfosfónico (AMPA) de bacterias aisladas de suelo agrícola con potencial en biorremediación. Tesis de Licenciatura. Valeria León Medina. 2023.

Aislamiento y caracterización de bacterias degradadoras de ácido aminometilfosfónico (AMPA) con potencial en biorremediación de suelos  expuestos a glifosato. Tesis de Licenciatura. Brenda Kirey Figueroa Iriarte. 2023.

Aislamiento y caracterización de bacterias degradadoras de glifosato aisladas de suelos agrícolas con potencial en biorremediación. Tesis de Licenciatura. Solangel Itzel Machado Valdez. 2023.

Extracción de proteínas en hojas y raíz de pimiento morrón (Capsicum annuum L.) y su análisis por electroforesis en una y dos dimensiones. Tesis de Licenciatura. René Rodríguez Sepúlveda. 2019.

Evaluación de marcadores moleculares asociados a la resistencia contra Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici en variedades comerciales de tomate. Tesis de Licenciatura. Martín Israel López Valenzuela. 2020

Premios y distinciones

• Miembro de la Sociedad Mexicana de Ciencias Hortícolas (SOMECH) 2023-2024.

• Sistema Nacional de Investigadores Nivel I 2021-2025.

• Evaluador acreditado RCEA-02-37798-2016

• Asesora e Integrante del Directorio de Verano Delfín( desde 2021)

• Divulgador de Ciencia Titular de Red Estatal de Divulgadores de la Ciencia y la Tecnología (RED-C 2023-202

• Miembro honorífico del Sistema Sinaloense de Investigadores y Tecnólogos (SSIT) 2022-2024.

Redes de investigación

Socio numerario de la Sociedad Mexicana de Biotecnología y Bioingeniería 2021-2022.

Miembro de la American Society of Plant Biologist Section Mexico 2020-2023

Área de Interés

– Análisis de los Mecanismos moleculares asociados a la degradación de agroquímicos y plaguicidas.

– Generación de inoculantes microbianos aplicados a procesos de biorremediación y como biofertilizantes.

– Diseño de formulaciones de bacteriófagos como antimicrobianos con aplicación en el área de salud y ciencias agropecuarias.

-Análisis de la diversidad y la Biología de bacteriófagos líticos y temperados aislados de diferentes fuentes ambientales.

– Caracterización de enzimas provenientes de fagos con novedosas aplicaciones biotecnológicas.

Publicaciones seleccionadas

1. Salazar-Gutiérez, et al. (2023). Transcriptomic Analysis Reveals the Response Mechanisms of Bell Pepper (Capsicum annuum)

2. Grimaldi-Olivas, et al. (2023). Transcriptomic analysis of bell pepper (Capsicum annuum L.) revealing key mechanisms in response

3. Morales-Merida, et al. (2023) RVE1, DBB1b and COL2 Transcription Factors are Responsive to Combined Stress by UV-B

4. Lafrance, et al. (2023). Response Surface Methodology for Optimization of Multiplex-PCR Protocols for Detection of TYLCV,

5. Martínez-Gallardo, et al. (2023). Current knowledge in the use of bacteriophages to combat infections caused by Pseudomonas

6. Criollo-Mendoza, et al. (2022). Cytotoxic Activity of Polyphenol Extracts from Three Oregano Species: Hedeoma patens, Lippia

7. Lafrance, et al. (2021). Optimization of PCR-based TYLCV molecular markers by response surface methodology. Gene, 785,

8. Morales-Merida, et al. (2021) Transcriptomic analysis of differentially expressed genes in response to combined stress by UV-

9. Amarillas, et al. (2021). The complete genome and comparative analysis of the phage phiC120 infecting multidrug-resistant

10. León-Félix, et al. (2021). The impact of quorum sensing on the modulation of phage-host interactions. Journal of bacteriology,

11. León-Chan, et al. (2020) Differential gene expression of anthocyanin biosynthetic genes under low temperature and ultraviolet-

12. Villicaña, et al. (2019). Occurrence and Abundance of Pathogenic Vibrio Species in Raw Oysters at Retail Seafood Markets

13. Rojas, et al. (2019). Involvement of OpsLTP1 from Opuntia streptacantha in abiotic stress adaptation and lipid metabolism.

14. Rodas-Junco, et al, (2017). Dental Pulp Stem Cells: Current Advances in Isolation, Expansion and Preservation. Tissue Engineering

15. Villicaña, et al. (2016) Antiporter NHX2 is differentially induced in Mesembryanthemum crystallinum natural genetic variant

16. Villicaña, et al. (2014). The basal transcription machinery as a target for cancer therapy. Cancer Cell International, 14(1),

17. Villicaña, et al. (2013). The genetic depletion or the triptolide inhibition of TFIIH in p53-deficient cells induces a JNK-dependent

18. Herrera-Cruz, et al. (2012). Physical and functional interactions between Drosophila homologue of Swc6/p18Hamlet subunit

Proyectos vigentes

1. Diseño de un consorcio sintético bacteriano con capacidad degradadora de glifosato y AMPA con
aplicación potencial en procesos de biorremediación

2. Aislamiento y caracterización de bacteriófagos líticos y temperados de Clavibacter michiganensis.

Docencia

Titular

Biología y Ecología de Bacteriófagos

Biología Celular

Colaborador

Biología Molecular

Técnicas Básicas de Biología Molecular

Evaluación de la expresión génica

Comisiones externas

Evaluador de solicitudes en convocatorias CONAHCYT

Evaluador de ingreso al SSIT

Revisor en revistas científicas Heliyon, Frontiers in Microbiology, Viruses, Current Issues in Molecular Biology, Microorganisms

Grupos de investigación
Laboratorios

Biología Molecular

Genómica Funcional

Líneas de Generación y Aplicación del Conocimiento

Biología molecular

Microbiología ambiental

Ciencias ómicas

Ingeniería genética