• Aislamiento y caracterización de fagos de bacterias patógenas de importancia en salud y agricultura.
• Clonación y caracterización de enzimas codificadas por fagos con potencial biotecnológico.
• Caracterización genómica, transcriptómica y funcional de bacterias degradadoras de agroquímicos, con propiedades
• promotoras del crecimiento en plantas y de patógenos de importancia en plantas y animales.
• Desarrollo de marcadores moleculares de plantas asociados a la resistencia a patógenos.
• Biología molecular y análisis ómico de plantas a diversos estreses bióticos y abióticos.

• Licenciatura en Biología Marina por la Universidad Autónoma de Baja California Sur (2004).
• Maestría en Ciencias por el Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S. C. (2007).
• Doctorado en Ciencias Bioquímicas por la Universidad Nacional Autónoma de México (2013).

• Biotecnología
• Agroecología
• Plaguicidas
• Microbiología ambiental
• Biología molecular y genómica funcional

1. Rubí-Rangel, L. M., León-Félix, J., & Villicaña, C. (2025). Exploring Viral Interactions in Clavibacter Species: In Silico Analysis of Prophage Prevalence and Antiviral Defenses. Life (Basel, Switzerland), 15(2), 187. https://www.mdpi.com/2075-1729/15/2/187
2. Villicaña, C., Moretti, C. H., & Carbonero, F. Editorial: Aging and the microbiome. Frontiers in Aging. 2024;5:1522703. Doi: 10.3389/fragi.2024.1522703
3. Lafrance, R., Villicaña, C., Valdéz-Torres, J. B., García-Estrada, R. S., Báez-Sañudo, M. A., Esparza-Araiza, M. J., & León-Félix J. Selection of Tomato (Solanum lycopersicum) Hybrids Resistant to Fol, TYLCV, and TSWV with Early Maturity and Good Fruit Quality. Horticulturae. 2024; 10(8):839. https://doi.org/10.3390/horticulturae10080839
4. Villicaña, C., Rubí-Rangel L. M., Amarillas L., Lightbourn-Rojas L. A., Carrillo-Fasio J. A., & León-Félix J. Isolation and Characterization of Two Novel Genera of Jumbo Bacteriophages Infecting Xanthomonas vesicatoria Isolated from Agricultural Regions in Mexico. Antibiotics (Basel). 2024;13(7):651. https://www.mdpi.com/2079-6382/13/7/651
5. Morales-Merida, B. E., Grimaldi-Olivas, J. C., Cruz-Mendívil A., et al. Integrating Proteomics and Metabolomics Approaches to Elucidate the Mechanism of Responses to Combined Stress in the Bell Pepper (Capsicum annuum). Plants (Basel). 2024;13(13):1861. https://www.mdpi.com/2223-7747/13/13/1861
6. Martínez-Gallardo, M. J., Villicaña, C., Yocupicio-Monroy, M., Alcaraz-Estrada, S. L., Salazar-Salinas, J., Mendoza-Vázquez, O. F., Damazo-Hernández, G., & León-Félix, J. (2024). Comparative genomic analysis of Pseudomonas aeruginosa strains susceptible and resistant to carbapenems and aztreonam isolated from patients with healthcare-associated infections in a Mexican hospital. Molecular Genetics and Genomics, 299(1), 29. https://doi.org/10.1007/s00438-024-02122-9
7. Salazar-Gutiérrez, D., Cruz-Mendívil, A., Villicaña, C., Heredia, J. B., Lightbourn-Rojas, L. A., & León-Félix, J. (2023). Transcriptomic Analysis Reveals the Response Mechanisms of Bell Pepper (Capsicum annuum) to Phosphorus Deficiency. Metabolites, 13(10), 1078. https://doi.org/10.3390/metabo13101078
8. Grimaldi-Olivas, J. C., Morales-Merida, B. E., Cruz-Mendívil, A., Villicaña, C., Heredia, J. B., López-Meyer, M., León-Chan, R., Lightbourn-Rojas, L. A., & León-Félix, J. (2023). Transcriptomic analysis of bell pepper (Capsicum annuum L.) revealing key mechanisms in response to low temperature stress. Molecular biology reports, 50(10), 8431–8444. https://doi.org/10.1007/s11033-023-08744-3
9. Morales-Merida, B. E., Grimaldi-Olivas, J. C., Cruz-Mendívil, A., Villicaña, C., Valdez-Torres, J. C., Heredia, J. B., León-Chan, R., Lightbourn-Rojas, L. L., & León-Félix, J. (2023) RVE1, DBB1b and COL2 Transcription Factors are Responsive to Combined Stress by UV-B Radiation and Cold in Bell Pepper (Capsicum annuum). Horticulturae, 9(6), 699. https://doi.org/10.3390/horticulturae9060699
10. Lafrance, R., Valdez-Torres, J. B., Villicaña, C., García-Estrada, R. S., Esparza-Araiza, M. J., & León-Félix, J. (2023). Response Surface Methodology for Optimization of Multiplex-PCR Protocols for Detection of TYLCV, TSWV and Fol Molecular Markers: Analytical Performance Evaluation. Genes, 14(2), 337. https://doi.org/10.3390/genes14020337
11. Martínez-Gallardo, M. J., Villicaña, C., Yocupicio-Monroy, M., Alcaraz-Estrada, S. L., & León-Félix, J. (2023). Current knowledge in the use of bacteriophages to combat infections caused by Pseudomonas aeruginosa in cystic fibrosis. Folia microbiologica, 68(1), 1–16 https://doi.org/10.1007/s12223-022-00990-5
12. Criollo-Mendoza, M. S., Ramos-Payán, R., Contreras-Angulo, L. A., Gutiérrez-Grijalva, E. P., León-Félix, J., Villicaña, C., Angulo-Escalante, M. A., & Heredia, J. B. (2022). Cytotoxic Activity of Polyphenol Extracts from Three Oregano Species: Hedeoma patens, Lippia graveolens and Lippia palmeri, and Antiproliferative Potential of Lippia graveolens against Two Types of Breast Cancer Cell Lines (MDA-MB-231 and MCF-7). Molecules (Basel, Switzerland), 27(16), 5240. https://doi.org/10.3390/molecules27165240
13. Lafrance, R., Villicaña, C., Valdéz-Torres, J. B., Martínez-Montoya, H., Castillo-Ruiz, O., Alemán-Castillo, S. E., Esparza-Araiza, M. J., & León-Félix, J. (2021). Optimization of PCR-based TYLCV molecular markers by response surface methodology. Gene, 785, 145606. https://doi.org/10.1016/j.gene.2021.145606
14. Morales-Merida, B. E., Villicaña, C., Perales-Torres, A. L., Martinez-Montoya, H., Castillo-Ruiz, O., León-Chan, R., Lightbourn-Rojas, L. A., Heredia, J. B., & León-Félix, J. (2021) Transcriptomic analysis of differentially expressed genes in response to combined stress by UV-B and cold radiation in pepper plant (Capsicum annuum L). International Journal of Agriculture and Biology 25(5), 969-980. http://dx.doi.org/10.17957/ijab/15.1753
15. Amarillas, L., Villicaña, C., Lightbourn-Rojas, L., González-Robles, A., & León-Félix, J. (2021). The complete genome and comparative analysis of the phage phiC120 infecting multidrug-resistant Escherichia coli and Salmonella strains. G3 (Bethesda, Md.), 11(2), jkab014. https://doi.org/10.1093/g3journal/jkab014
16. León-Félix, J., & Villicaña, C. (2021). The impact of quorum sensing on the modulation of phage-host interactions. Journal of Bacteriology, 203(9), e00687-20. https://doi.org/10.1128/JB.00687-20
17. León-Chan, R. G., Lightbourn-Rojas, L. A., López-Meyer, M., Amarillas, L., Heredia, J. B., Martínez-Bastidas, T. F., Villicaña, C., & León Félix, J. (2020) Differential gene expression of anthocyanin biosynthetic genes under low temperature and ultraviolet-B radiation in bell pepper (Capsicum annuum). International Journal of Agriculture and Biology 23(3), 531-538. DOI: 10.17957/IJAB/15.1315
18. Villicaña, C., Amarillas, L., Soto-Castro, L., Gómez-Gil, B., Lizárraga-Partida, M. L., & León-Félix, J. (2019). Occurrence and Abundance of Pathogenic Vibrio Species in Raw Oysters at Retail Seafood Markets in Northwestern Mexico. Journal of Food Protection, 82(12), 2094–2099. https://doi.org/10.4315/0362-028X.JFP-19-237
19. Rojas, M., Jimenez-Bremont, F., Villicaña, C., Carreón-Palau, L., Arredondo-Vega, B. O., & Gómez-Anduro, G. (2019). Involvement of OpsLTP1 from Opuntia streptacantha in abiotic stress adaptation and lipid metabolism. Functional Plant Biology: FPB, 46(9), 816–829. https://doi.org/10.1071/FP18280
20. Rodas-Junco, B. A., & Villicaña, C. (2017). Dental Pulp Stem Cells: Current Advances in Isolation, Expansion and Preservation. Tissue Engineering and Regenerative Medicine, 14(4), 333–347. https://doi.org/10.1007/s13770-017-0036-3
21. Villicaña, C., Warner, N., Arce-Montoya, M., Rojas, M., Angulo, C., Orduño, A., & Gomez-Anduro, G. (2016) Antiporter NHX2 is differentially induced in Mesembryanthemum crystallinum natural genetic variant under salt stress. Plant Cell Tissue and Organ Culture, 124, 361-365. https://link.springer.com/article/10.1007/s11240-015-0900-6
22. Villicaña, C., Cruz, G., & Zurita, M. (2014). The basal transcription machinery as a target for cancer therapy. Cancer Cell International, 14(1), 18. https://doi.org/10.1186/1475-2867-14-18
23. Villicaña, C., Cruz, G., & Zurita, M. (2013). The genetic depletion or the triptolide inhibition of TFIIH in p53-deficient cells induces a JNKdependent cell death in Drosophila. Journal of Cell Science, 126(Pt 11), 2502–2515. https://doi.org/10.1242/jcs.122721
24. Herrera-Cruz, M., Cruz, G., Valadez-Graham, V., Fregoso-Lomas, M., Villicaña, C., Vázquez, M., Reynaud, E., & Zurita, M. (2012). Physical and functional interactions between Drosophila homologue of Swc6/p18Hamlet subunit of the SWR1/SRCAP chromatin-remodeling complex with the DNA repair/transcription factor TFIIH. The Journal of Biological Chemistry, 287(40), 33567–33580. https://doi.org/10.1074/jbc.M112.383505

1. Desarrollo de protocolos de PCR tiempo real para el diagnóstico de bacterias fitopatógenas de importancia en el cultivo de tomate.
2. Aislamiento y caracterización de bacteriófagos líticos y temperados de Clavibacter michiganensis

EN PROCESO

• Eunice Perez Fonseca: Bacteriófagos como alternativa a los antibióticos promotores del crecimiento en codorniz japonesa.
• Itan Gabriel Smith: Caracterización fenotípica y molecular de la fagorresistencia inducida en cepas clínicas de Pseudomonas aeruginosa MDR.
• Lucía Margarita Rubí Rangel: Papel de los profagos en la biología de Clavibacter michiganensis.
• Alejandro Payán García: Desarrollo y caracterización funcional y molecular de inoculantes bacterianos con potencial en biorremediación y promoción del crecimiento vegetal.
• Alexandra Yaquelin Guzmán López: Análisis transcriptómico de la interacción planta-patógeno de Clavibacter michiganensis.
• Juan Carlos Grimaldi García: Diversidad genética de virus patógenos en tomate.
• Fátima Itzel Chávez Mejía: Identificación de marcadores ISSR específicos en variedades de maíz con tolerancia a estrés hídrico

 TITULADOS

• Alejandro Payán García (CIAD, maestría 2022-2024): “Caracterización genómica y funcional de bacterias degradadoras de glifosato y AMPA con potencial en biorremediación”.
• Alexandra Yaquelin Guzmán López (CIAD, maestría 2022-2024): “Genómica comparativa de cepas de Clavibacter michiganensis aisladas en México”.
• Karla Selena Osuna Flores (Lic. Biomedicina UAS, 2021-2024): “Estandarización de un método molecular para la detección de Colletotrichum asociado a hojas de mango con antracnosis”.
• Valeria León Medina (Lic. Biomedicina UAS, 2021-2023): “Evaluación de la capacidad degradadora de glifosato y ácido aminometilfosfónico (AMPA) de bacterias aisladas de suelo agrícola con potencial en biorremediación”.
• Solangel Itzel Valdés Machado (Lic. Biomedicina UAS, 2021-2023): “Aislamiento y caracterización de bacterias degradadoras de glifosato aisladas de suelos agrícolas con potencial en biorremediación”.
• Brenda Kirey Figueroa Iriarte (Lic. Biomedicina UAS, 2021-2023): “Aislamiento y caracterización de bacterias degradadoras de ácido aminometilfosfónico (AMPA) con potencial en biorremediación de suelos expuestos a glifosato”.
• Martín Israel López Valenzuela. Evaluación de marcadores moleculares asociados a la resistencia contra Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici en variedades comerciales de tomate. Lic. en Ing. Agronómica, UAS.
• René Rodríguez Sepúlveda. Extracción de proteínas en hojas y raíz de pimiento morrón (Capsicum annuum L.) y su análisis por electroforesis en una y dos dimensiones. Lic. en Ing. Agronómica, UAS.

Titular

• Biología y Ecología de Bacteriófagos
• Biología Celular

Colaborador

• Biología Molecular
• Técnicas Básicas de Biología Molecular
• Evaluación de la expresión génica

• Miembro de la Sociedad Mexicana de Ciencias Hortícolas (SOMECH) 2023-2024.
• Sistema Nacional de Investigadores Nivel I 2021-2025.
• Evaluador acreditado RCEA-02-37798-2016
• Asesora e Integrante del Directorio de Verano Delfín( desde 2021)
• Divulgador de Ciencia Titular de Red Estatal de Divulgadores de la Ciencia y la Tecnología (RED-C)
• Miembro honorífico del Sistema Sinaloense de Investigadores y Tecnólogos (SSIT) 2024-2026.

• Evaluador de solicitudes en convocatorias CONAHCYT
• Evaluador de ingreso al SSIT
• Revisor en revistas científicas Heliyon, Frontiers in Microbiology, Viruses, Current Issues in Molecular Biology, Microorganisms, BMC Microbiology

• Socio numerario de la Sociedad Mexicana de Biotecnología y Bioingeniería 2021-2022.
• Miembro de la American Society of Plant Biologist Section Mexico 2020-2023