Dr. Marcel Martínez Porchas
Dr. Marcel Martínez Porchas

Profesor Investigador Titular C
SNI III

Líneas de investigación: Fisiología de organismos acuáticos; Microbiota de organismos acuáticos y sistemas acuícolas; Mejoramiento de sistemas de producción; Uso de peces como modelo biológico

Acuicultura Biología molecular Metagenómica

Google AcadémicoResearchGateScopus

Estancias posdoctorales

Proyecto

Estudio genómico y transcriptómico de las enfermedades granulomatosas en tilapia: un modelo para entender la interacción huésped patógeno en peces

Campo de especialización requerido

Biología molecular, biología y acuicultura

Coordinación

Tecnología de Alimentos de Origen Animal

Teléfono

(+52) 662 289 2400, ext. 618

Correo electrónico

marcel@ciad.mx

  • Licenciatura: Químico Biólogo, Universidad de Sonora (2004)
  • Maestría: Maestro en Ciencias, Universidad de Sonora (2006)
  • Doctorado: Doctorado en Ciencias, Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada (2009)
  • Acuicultura
  • Diseño de microbiota sintética
  • Uso de peces como modelo biológico para comprender la función de la microbiota intestinal y enfermedades humanas
  • Medina-Felix, D., Vargas-Albores, F., Garibay-Valdez, E., Martínez-Córdova, L. R., & Martínez-Porchas, M. (2024). Gastrointestinal dysbiosis induced by Nocardia sp. infection in tilapia. Comparative Biochemistry and Physiology Part D: Genomics and Proteomics, 49, 101154.
  • Medina‐Félix, D., Garibay‐Valdez, E., Vargas‐Albores, F., & Martínez‐Porchas, M. (2023). Fish disease and intestinal microbiota: A close and indivisible relationship. Reviews in Aquaculture, 15(2), 820-839.
  • Martinez-Porchas, M., Preciado-Álvarez, A., Vargas-Albores, F., Gracia-Valenzuela, M. H., Cicala, F., Martinez-Cordova, L. R., … & Garibay-Valdez, E. (2023). Microbiota plasticity in tilapia gut revealed by meta-analysis evaluating the effect of probiotics, prebiotics, and biofloc. PeerJ, 11, e16213.
  • Rajme-Manzur, D., Hernández-López, J., Martínez-Porchas, M., Vargas-Albores, F., Garibay-Valdez, E., Coronado-Molina, D. E., … & Santacruz, A. (2023). Staphylococcus haemolyticus and Providencia vermicola infections occurring in farmed tilapia: Two potentially emerging pathogens. Animals, 13(23), 3715.
  • Vargas-Albores, F., Martínez-Córdova, L. R., Hernández-Mendoza, A., Cicala, F., Lago-Lestón, A., & Martínez-Porchas, M. (2021). Therapeutic modulation of fish gut microbiota, a feasible strategy for aquaculture?. Aquaculture, 544, 737050.
  • Martinez-Cordova, L. R., Emerenciano, M. G., Miranda-Baeza, A., Pinho, S. M., Garibay-Valdez, E., & Martínez-Porchas, M. (2023). Advancing toward a more integrated aquaculture with polyculture> aquaponics> biofloc technology> FLOCponics. Aquaculture International, 31(2), 1057-1076.
  • Rajme-Manzur, D., Gollas-Galván, T., Vargas-Albores, F., Martínez-Porchas, M., Hernández-Oñate, M. Á., & Hernández-López, J. (2021). Granulomatous bacterial diseases in fish: An overview of the host’s immune response. Comparative Biochemistry and Physiology Part A: Molecular & Integrative Physiology, 261, 111058.
  • Emerenciano, M. G., Miranda-Baeza, A., Martínez-Porchas, M., Poli, M. A., & Vieira, F. D. N. (2021). Biofloc technology (BFT) in shrimp farming: past and present shaping the future. Frontiers in Marine Science, 8, 813091.

Doctorado

  • Análisis transcriptómico en la tilapia ante infecciones por Nocardia asteroides y Providencia vermicola: un modelo para estudiar la respuesta a enfermedades bacterianas granulomatosas en peces.. Estudiante: Rajme Manzur David.
  • Composición y funcionalidad de la microbiota intestinal de jurel cola amarilla (Seriola dorsalis) alimentado con dietas adicionadas con ajo.. Estudiante: Valenzuela Gutiérrez Rocio Aracely.
  • Perfil Taxonómico y Funcional de la Microbiota del Tracto Digestivo del Camarón Blanco Litopenaeus vannamei Durante su Crecimiento. Estudiante: Garibay Valdez Estefanía. CIAD, A.C.
  • Identificación y caracterización de las proteínas integrales de membrana de la bacteria de la necrosis hepatopancreática y de la cepa ATCC17802 y cepa 22 de Vibrio parahaemolyticus. Estudiante: Jesús Alberto Pérez Acosta.

Maestría

  • Detección de Unidades Taxonómicas Operacionales Empleando Cebadores Diseñados a Partir de Fragmentos con Alto Grado de Conservación del ARNr 16S.. Estudiante: Valenzuela Gutiérrez Rocío Aracely.
  • Evaluación de la diversidad de bacterias presentes en bioflóculos provenientes de cultivos hiper-intensivos de camarón a través de secuenciación masiva del gen 16S ARNr. Estudiante: José Alberto Huerta Rábago.
  • Diversidad Bacteriana Intestinal en Litopenaeus vannamei Cultivado en un Sistema con Biopelículas Fotoautotróficas como Alimento Natural Complementario. Estudiante: Garibay Valdez Estefanía.

Licenciatura

  • Expresión diferencial de genes de respuesta inmune en tilapia (Oreochromis niloticus) retada experimentalmente con bacterias causantes de enfermedades granulomatosas y no granulomatosas. Estudiante: CINTHIA ALEJANDRA OLIVAS BERNAL.
  • Meta-análisis para definir una microbiota central en el intestino del pez cebra (Danio rerio). Estudiante: GARCIA GODINEZ DIANA MARBELLA.
  • Respuesta fisiológica y expresión de genes de proteínas del choque térmico del camarón blanco (Litopenaeus vannamei) infectado con la bacteria causante de la necrosis hepatopancreática (BNHP) y medicado con oxitetraciclina y florfenicol. Estudiante: Rocío Aracely Valenzuela Gutiérrez
  • Redacción Científica
  • Biología Computacional
  • Reconocimiento al Mérito Académico. Instituto Tecnológico de Monterrey (2014)

Comité Editorial de:

  • Frontiers in Marine Sciences (FRONTIERS)
  • Gene Reports (ELSEVIER)
  • Scientific Reports (NATURE)
Formación profesional
  • Licenciatura: Químico Biólogo, Universidad de Sonora (2004)
  • Maestría: Maestro en Ciencias, Universidad de Sonora (2006)
  • Doctorado: Doctorado en Ciencias, Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada (2009)
Áreas de Interés
  • Acuicultura
  • Diseño de microbiota sintética
  • Uso de peces como modelo biológico para comprender la función de la microbiota intestinal y enfermedades humanas
Publicaciones seleccionadas
  • Medina-Felix, D., Vargas-Albores, F., Garibay-Valdez, E., Martínez-Córdova, L. R., & Martínez-Porchas, M. (2024). Gastrointestinal dysbiosis induced by Nocardia sp. infection in tilapia. Comparative Biochemistry and Physiology Part D: Genomics and Proteomics, 49, 101154.
  • Medina‐Félix, D., Garibay‐Valdez, E., Vargas‐Albores, F., & Martínez‐Porchas, M. (2023). Fish disease and intestinal microbiota: A close and indivisible relationship. Reviews in Aquaculture, 15(2), 820-839.
  • Martinez-Porchas, M., Preciado-Álvarez, A., Vargas-Albores, F., Gracia-Valenzuela, M. H., Cicala, F., Martinez-Cordova, L. R., … & Garibay-Valdez, E. (2023). Microbiota plasticity in tilapia gut revealed by meta-analysis evaluating the effect of probiotics, prebiotics, and biofloc. PeerJ, 11, e16213.
  • Rajme-Manzur, D., Hernández-López, J., Martínez-Porchas, M., Vargas-Albores, F., Garibay-Valdez, E., Coronado-Molina, D. E., … & Santacruz, A. (2023). Staphylococcus haemolyticus and Providencia vermicola infections occurring in farmed tilapia: Two potentially emerging pathogens. Animals, 13(23), 3715.
  • Vargas-Albores, F., Martínez-Córdova, L. R., Hernández-Mendoza, A., Cicala, F., Lago-Lestón, A., & Martínez-Porchas, M. (2021). Therapeutic modulation of fish gut microbiota, a feasible strategy for aquaculture?. Aquaculture, 544, 737050.
  • Martinez-Cordova, L. R., Emerenciano, M. G., Miranda-Baeza, A., Pinho, S. M., Garibay-Valdez, E., & Martínez-Porchas, M. (2023). Advancing toward a more integrated aquaculture with polyculture> aquaponics> biofloc technology> FLOCponics. Aquaculture International, 31(2), 1057-1076.
  • Rajme-Manzur, D., Gollas-Galván, T., Vargas-Albores, F., Martínez-Porchas, M., Hernández-Oñate, M. Á., & Hernández-López, J. (2021). Granulomatous bacterial diseases in fish: An overview of the host’s immune response. Comparative Biochemistry and Physiology Part A: Molecular & Integrative Physiology, 261, 111058.
  • Emerenciano, M. G., Miranda-Baeza, A., Martínez-Porchas, M., Poli, M. A., & Vieira, F. D. N. (2021). Biofloc technology (BFT) in shrimp farming: past and present shaping the future. Frontiers in Marine Science, 8, 813091.
Dirección de tesis

Doctorado

  • Análisis transcriptómico en la tilapia ante infecciones por Nocardia asteroides y Providencia vermicola: un modelo para estudiar la respuesta a enfermedades bacterianas granulomatosas en peces.. Estudiante: Rajme Manzur David.
  • Composición y funcionalidad de la microbiota intestinal de jurel cola amarilla (Seriola dorsalis) alimentado con dietas adicionadas con ajo.. Estudiante: Valenzuela Gutiérrez Rocio Aracely.
  • Perfil Taxonómico y Funcional de la Microbiota del Tracto Digestivo del Camarón Blanco Litopenaeus vannamei Durante su Crecimiento. Estudiante: Garibay Valdez Estefanía. CIAD, A.C.
  • Identificación y caracterización de las proteínas integrales de membrana de la bacteria de la necrosis hepatopancreática y de la cepa ATCC17802 y cepa 22 de Vibrio parahaemolyticus. Estudiante: Jesús Alberto Pérez Acosta.

Maestría

  • Detección de Unidades Taxonómicas Operacionales Empleando Cebadores Diseñados a Partir de Fragmentos con Alto Grado de Conservación del ARNr 16S.. Estudiante: Valenzuela Gutiérrez Rocío Aracely.
  • Evaluación de la diversidad de bacterias presentes en bioflóculos provenientes de cultivos hiper-intensivos de camarón a través de secuenciación masiva del gen 16S ARNr. Estudiante: José Alberto Huerta Rábago.
  • Diversidad Bacteriana Intestinal en Litopenaeus vannamei Cultivado en un Sistema con Biopelículas Fotoautotróficas como Alimento Natural Complementario. Estudiante: Garibay Valdez Estefanía.

Licenciatura

  • Expresión diferencial de genes de respuesta inmune en tilapia (Oreochromis niloticus) retada experimentalmente con bacterias causantes de enfermedades granulomatosas y no granulomatosas. Estudiante: CINTHIA ALEJANDRA OLIVAS BERNAL.
  • Meta-análisis para definir una microbiota central en el intestino del pez cebra (Danio rerio). Estudiante: GARCIA GODINEZ DIANA MARBELLA.
  • Respuesta fisiológica y expresión de genes de proteínas del choque térmico del camarón blanco (Litopenaeus vannamei) infectado con la bacteria causante de la necrosis hepatopancreática (BNHP) y medicado con oxitetraciclina y florfenicol. Estudiante: Rocío Aracely Valenzuela Gutiérrez
Docencia
  • Redacción Científica
  • Biología Computacional
Premios y Distinciones
  • Reconocimiento al Mérito Académico. Instituto Tecnológico de Monterrey (2014)
Comisiones Externas

Comité Editorial de:

  • Frontiers in Marine Sciences (FRONTIERS)
  • Gene Reports (ELSEVIER)
  • Scientific Reports (NATURE)
Grupos de investigación
Laboratorios
Líneas de Generación y Aplicación del Conocimiento
  • Acuicultura, Microbiología, Microbiota intestinal