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• A.M. van der Heiden, and P.A. Hastings. 2008. Molecular identification of the bonefish Albula esuncula (Albuliformes: Albulidae) from the tropical eastern Pacific, with comments on distribution and morphology. Copeia 2008(4): 763-770.
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• Hendrickson, D.A., H. Espinosa Pérez, L.T. Findley, W. Forbes, J.R. Tomelleri, R.L. Mayden, J.L. Nielsen, B. Jensen, G. Ruiz Campos, A. Varela Romero, A. van der Heiden, F. Camarena, and F.J. Garcia de León. 2002. Mexican native trouts: a review of their history and current systematic and conservation status. Reviews in Fish Biology and Fisheries 12: 273-316.
• A. van der Heiden, F. Camarena, and F.J. Garcia de León. 2002. Mexican native trouts: a review of their history and current systematic and conservation status. Reviews in Fish Biology and Fisheries 12: 273-316.
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• van der Heiden, A.M. y H.G. Plascencia González. 1997. Primeros registros de Syacium longidorsale Murakami y Amaoka, 1992 y Brotula ordwayi Hildebrand y Barton, 1949 (Teleostei: Paralichthyidae y Ophidiidae) para la costa Pacífica de México. Vertebrata Mexicana 1997(4): 5-8.
• van der Heiden, A.M., and S. Mussot-Pérez. 1995. Citharichthys mariajorisae, a new flatfish from the shallow coastal waters of the eastern tropical Pacific (Pleuronectiformes: Paralichthyidae). Copeia 1995(2): 439-446.
• van der Heiden, A.M., and S. Mussot-Pérez. 1993. Dorsopsetta and D. norma, both Nielsen, 1963, junior synonyms of Cyclopsetta Gill, 1889, and C. querna (Jordan and Bollman, 1890) (Pleuronectiformes: Paralichthyidae). Copeia 1993(2): 557-560.
• van der Heiden, A.M., and S. Mussot-Pérez. 1992. Secondary sexual dimorphism and dichromatism in Gulf of California flatfishes. Copeia 1992(4): 1077-1080.
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• A.M. van der Heiden, y A. Toledano-Granados. 1984. Resultados de las Campañas SIPCO (Sur de Sinaloa, México) a bordo del B/O «El Puma». Hidrología y composición de las capturas efectuadas en los arrastres.  Anales del Instituto de Ciencias del Mar y Limnología, Univ. Nal. Autón. de México 11(1): 107-122.
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• A.M. van der Heiden, and R. Briseño-Dueñas. 1983.  Fauna survey of the decapod crustaceans, reptiles and coastal birds of the Estero El Verde, Sinaloa, Mexico, with some notes on their biology.  Anales del Instituto de Ciencias del Mar y Limnología, Univ. Nal. Autón. de México 10(1): 187-194.
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• A.M. van der Heiden. 1981.  Range extensions of three species of brachyuran crabs on the Pacific coast of America, Crustaceana 40(3): 313-315.
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• van der Heiden, A.M. 1975. The structure of the anterior feeding apparatus in members of the Ironidae (Nematoda: Enoplida). Nematologica 20 (para 1974): 419-439.
• A.M. van der Heiden. 1971.  Structure and formation of the feeding apparatus in Aporcelaimus and Aporcelaimellus (Nematoda: Dorylaimida).  Zeitschrift für Morphologie der Tiere 70: 102-118.
• Syacium maculiferum (Garman, 1899), an endemic species of Cocos Island, Costa Rica (Pleuronectiformes: Paralichthyidae). Copeia 1998(3): 753-758.
• Syacium longidorsale Murakami y Amaoka, 1992 y Brotula ordwayi Hildebrand y Barton, 1949 (Teleostei: Paralichthyidae y Ophidiidae) para la costa Pacífica de México. Vertebrata Mexicana 1997(4): 5-8.
• Citharichthys mariajorisae, a new flatfish from the shallow coastal waters of the eastern tropical Pacific (Pleuronectiformes: Paralichthyidae). Copeia 1995(2): 439-446.
• Dorsopsetta and D. norma, both Nielsen, 1963, junior synonyms of Cyclopsetta Gill, 1889, and C. querna (Jordan and Bollman, 1890) (Pleuronectiformes: Paralichthyidae). Copeia 1993(2): 557-560.
• van der Heiden, A.M., and H. Plascencia-González. 1990. Range extensions of the lophiid anglerfish Lophiodes spilurus and the stingray Urotrygon nana, along the Pacific coast of America. Revista de Biología Tropical 38(1): 147.
• Harriotta raleighana (Holocephali: Rhinochimeridae) and description of copulation marks. Revista de Biología Tropical 33(2): 185-188.
• Aporcelaimus and Aporcelaimellus (Nematoda: Dorylaimida).  Zeitschrift für Morphologie der Tiere 70: 102-118.

Capítulos en Libros 

• van der Heiden, A.M., H.G. Plascencia-González, J.L. Villalobos-Hiriart y H.S. Espinosa-Pérez (en prensa, 2020). Los peces y macrocrustáceos decápodos de la cuenca media del río Pánuco en la Sierra Madre Occidental del sur de Sinaloa, México. En: González Elizondo, M.S., M. González Elizondo y Citlali Cortés Montaño (eds.). Biodiversidad y Paisaje de la Sierra Madre Occidental. Instituto Politécnico Nacional-CONABIO.
• Ruiz Guerrero, M., T.R. Van Devender, A.L. Reina Guerrero, P. Mejía Mora y A.M. van der Heiden (en prensa, 2020). Flora de La Guásima, Región Prioritaria para la Conservación en la Sierra Madre Occidental, sur de Sinaloa, México. En: González Elizondo, M.S., M. González Elizondo y Citlali Cortés Montaño (eds.). Biodiversidad y Paisaje de la Sierra Madre Occidental. Instituto Politécnico Nacional-CONABIO.
• van der Heiden, A.M., H.G. Plascencia González y M. Ruiz Guerrero 2016. Estado actual de la Colección de Referencia de Peces del Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo, A. C. – Unidad Mazatlán, México, 18: 187-197. Colecciones Ictiológicas de Latinoamérica. Universidad Nacional Autónoma de México, Facultad de Estudios Superiores Iztacala, Sociedad Ictiológica Mexicana A.C., 572 pp.
• Hastings, P.A., L.T. Findley, and A.M. van der Heiden. 2010. Fishes of the Gulf of California, Chapter 5: 97-118. En: Brusca, R.C. (Ed.) The Gulf of California. Biodiversity and Conservation. Arizona University Press and Arizona-Sonora Desert Museum, Tucson, E.U.A., 354 pp.
• Guido Sánchez, S., A.M. van der Heiden, M. Ruiz Guerrero, P. Mejía Mora, H. Plascencia González y E. García Campos. 2006. La Guásima, Concordia, una comunidad en camino hacia la sustentabilidad, p. 279-302. En: Cifuentes Lemus, J.L. y J. Gaxiola López (Eds.). Atlas del Manejo y  Conservación de la Biodiversidad y Ecosistemas de Sinaloa. El Colegio de Sinaloa, Culiacán, Sinaloa, México, 360 pp.
• Mariscal Romero, J. y A.M. van der Heiden. 2006. Peces de importancia ecológica y comercial asociados a fondos blandos en la plataforma continental de Jalisco y Colima, México, p. 180-195. En: Jiménez Quiroz, Ma. del C. y E. Espino Barr (Eds.). Los recursos pesqueros y acuícolas de Jalisco, Colima y Michoacán. Crip-Manzanillo, SAGARPA, 622 pp.
• Brusca, R.C., L.T. Findley, P.A. Hastings, M.E. Hendrickx, J. Torre Cosio, and A.M. van der Heiden. 2005. Macrofaunal diversity in the Gulf of California, Chapter 9: 179-203. In: Cartron, J.-L. E., G. Ceballos, and R. S. Felger (Eds.) Biodiversity, Ecosystems, and Conservation in Northern Mexico. Oxford University Press, New York, 496 pp.
• van der Heiden, A.M. y H.G. Plascencia González. 2002. La fauna endémica del estado de Sinaloa: 423-429. En: Cifuentes Lemus J.L. y J. Gaxiola López (Ed.) Atlas de la Biodiversidad de Sinaloa. El Colegio de Sinaloa, Culiacán, 442 pp.
• van der Heiden, A.M. 1985. Taxonomía, biología y evaluación de la ictiofauna demersal del Golfo de California, Cap. 4: 149-200. En: Yáñez-Arancibia, A. (Ed.) Recursos pesqueros potenciales de México, la pesca acompañante del camarón. Programa Universitario de Alimentos, Instituto de Ciencias del Mar y Limnología, Instituto Nacional de la Pesca, UNAM, México, D.F., 748 pp.

 Publicaciones otras

• Van Devender, T.R., M. Ruiz Guerrero, A.L. Reina Guerrero, P. Mejía Mora, S. Guido Sánchez y A.M. van der Heiden. 2012. Flora de La Guásima, Concordia, Sinaloa, México. Región Prioritaria para la Conservación. Versión 1.0 (agosto 2012), 49  pp., disponible en http://www.ciad.mx/herbario.
• International Union for Conservation of Nature and Natural Resources (IUCN) 2007. Red List of Threatened Species. Version 2010.3. www.iucnredlist.org. Especies evaluadas:
  • Bearez, B., A. van der Heiden, A. Acero, P. Rojas, R. Betancur, and H. Espinosa. Eucinostomus currani.
  • Chao, L., H. Espinosa, and A. van der Heiden. Micropogonias ectenes y  Micropogonias megalops.
  • Chao, L., H. Espinosa, L. Findley, and A. van der Heiden. Bairdiella icistia, Cynoscion albus, Cynoscion nannus, Cynoscion othonopterus, Cynoscion parvipinnis, Cynoscion phoxocephalus, Cynoscion reticulatus, Cynoscion squamipinnis y Cynoscion stolzmanni.
  • Chao, L., H. Espinosa, A. van der Heiden, and P. Bearez. Nebris occidentalis.
  • Chao, L., R. Robertson, H. Espinosa, L. Findley, and A. van der Heiden. Atractoscion nobilis, Bairdiella armata, Bairdiella ensifera, Corvula macrops, Cheilotrema saturnum, Elattarchus archidium, Isopisthus remifer, Larimus acclivis, Larimus argenteus, Larimus effulgens, Larimus pacificus, Menticirrhus elongatus, Menticirrhus nasus Menticirrhus paitensis, Menticirrhus panamensis, Menticirrhus undulatus y Micropogonias altipinnis.
  • Cotto, A., A. Acero, P. Rojas, and A. van der Heiden. Centropomus nigrescens, Centropomus robalito, Centropomus unionensis y Centropomus viridis.
  • Espinosa-Perez, H., L.T. Findley, and A.M. van der Heiden. Cynoscion xanthulus.
  • Findley, L., J. Van Tassell, and A. van der Heiden. Coryphopterus urospilus.
  • Lea, B., and A. van der Heiden. Paralichthys californicus.
  • Rojas, P., A. Cotto, A. Acero, A. van der Heiden, and P. Bearez. Eucinostomus dowii.
  • van der Heiden, A. Citharichthys fragilis, Citharichthys gilberti, Citharichthys gnathus, Citharichthys gordae, Citharichthys mariajorisae, Citharichthys platophrys, Cyclopsetta querna, Cyclopsetta panamensis, Etropus ciadi, Etropus peruvianus, Syacium latifrons, Syacium longidorsale, Syacium maculiferum, Syacium ovale y Xystreurys liolepis.
  • van der Heiden, A., and A. Acero. Centropomus medius.
  • van der Heiden, A., and L. Findley. Paralichthys aestuarius.
  • van der Heiden, A., and B. Lea. Hippoglossina bollmani.
  • van der Heiden, A., B. Lea, and L. Findley. Paralichthys woolmani, Pleuronichthys guttulatus, Pleuronichthys ocellatus, Pleuronichthys ritteri, Pleuronichthys verticalis y Pseudorhombus binii.
  • van der Heiden, A., P. Rojas, A. Cotto. Diapterus aureolus.
  • van der Heiden, A., A. Cotto, P. Rojas, and P. Bearez. Bellator loxias y Prionotus birostratus.
  • van der Heiden, A., A. Cotto, P. Rojas, P. Bearez, and B. Collette. Bellator xenisma, Prionotus horrens, Prionotus ruscarius y Prionotus stephanophrys.
• Findley, L.T., M.E. Hendrickx, R.C. Brusca, A.M. van der Heiden, P.A. Hastings, and J. Torre. 2007 (versión 2.0). Marine Macrofaunal Diversity of the Gulf of California, Mexico. CD-ROM  Macrofauna-Golfo Project. Copyright and all rights reserved by the authors and Conservation International (versión inglés y español).
• Pacheco Aguilar, R. et al. 2003. Catálogo electrónico para la identificación taxonómica y bioquímica de los peces del Golfo de California (CD-ROM). Co-investigador principal.
• Ugalde-Caballero, G., A. van der Heiden, J. Alvarado-Díaz, A. Ruiz-Luna y M. Nieves-Soto. 2003. Caracterización de la Colonia Anidatoria de la Tortuga Negra, Chelonia agassizi Bocourt, 1868 (Reptilia: Testudinata) de Colola, Michoacán, México, con base en Caracteres Morfológicos, Merísticos y Reproductivos. Boletín CIAD 12(3): 2-3.
• Plascencia González, H.G. y A.M. van der Heiden. 1999. La captura de escama en la pesquería de la langosta en el sur de Sinaloa, México. Pesca y Conservación 3(9): 6-8.
• van der Heiden, A.M. y M.E. Hendrickx. 1982. Inventario de la fauna marina y costera del sur de Sinaloa, México. Segundo Informe de Avance, i-vi, 135 pp.  Instituto de Ciencias del Mar y Limnología, Estación Mazatlán, UNAM. Incluye: van der Heiden, A.M., L.T. Findley, S. Rodríguez-Cajiga y M.E. Hendrickx: Inventario de los peces marinos y aguas costeras del sur de Sinaloa, México: 76-96.
• van der Heiden, A.M. y M.E. Hendrickx. 1979.  Inventario de la fauna marina y costera del sur de Sinaloa, México (list of the marine and coastal fauna of southern Sinaloa, Mexico). Estación Mazatlán, Centro de Ciencias del Mar y Limnología, UNAM, i-vii, 71 pp.

• Responsable: Distribución de flora y fauna en la zona núcleo de Monte Mojino. CIAD-CONANP, agosto-diciembre 2011.
• Responsable: Ampliación del inventario florístico y faunístico de la Región Prioritaria para la Conservación “Monte Mojino”, Concordia-Rosario, Sinaloa, México. CONABIO, aprobado pero sin alcanzar financiamiento, 2011.
• Participación: Estudio Previo Justificativo para el establecimiento de una nueva Área Natural Protegida “Monte Mojino” de competencia de la Federación en los Municipios de Concordia y Rosario, Sinaloa. CONANP, Fundación David and Lucile Packard, CONSELVA/CIAD, 2009-2010 (actualización 2014).
• Participación: Ordenamiento Territorial Comunitario del Ejido Palos Blancos, Rosario, Sin. CONAFOR y Conselva Conservación y Uso Sustentable de la Selva Tropical Seca A.C./CIAD, 2010.
• Participación: Ordenamiento Territorial Comunitario de la Comunidad La Guásima, Concordia, Sin. CONAFOR y Conselva Conservación y Uso Sustentable de la Selva Tropical Seca A.C./CIAD, 2010.
• Responsable: Monitoreo, Conservación y Manejo de los Recursos Naturales de los sitios de dificil acceso en el noroeste de la Comunidad La Guásima, Concordia, Sinaloa. CONANP/CIAD, agosto-diciembre 2010.
• Responsable: Estudio de los anfíbios y reptiles de la Comunidad La Guasima, Concordia, Sinaloa. CONANP-SEMARNAT/CIAD, julio-diciembre 2008.
• Responsable: Estudio de la diversidad de peces y macrocrustáceos del Río Pánuco y los arroyos de la Comunidad «La Guásima», Concordia, Sinaloa. CONANP-SEMARNAT, mayo-noviembre, 2006.
• Participación: Ordenamiento ecológico comunitario participativo Meseta de Cacaxtla, Sin. PNUD – CONANP – CIAD, 2006.
• Participación: Programa de Conservación y Manejo de la Meseta de Cacaxtla. Actualización y Reingeniería. CONANP – CIAD, 2006.
• Participación: Programa de Desarrollo Comunitario del Ejido Guillermo Prieto, San Ignacio, Sinaloa. APFyF Meseta de Cacaxtla. CONANP-CIAD, 2006.
• Responsable: Monitoreo de los recursos naturales de la Comunidad La Guásima, Concordia, Sinaloa. SEMARNAT-CIAD, 2005 – 2006.
• Participación: Plan de manejo comunitario de los recursos naturales de la Comunidad La Guásima, Concordia, Sinaloa. Parte I. Diagnósticos ambiental y productivo con recomendaciones preliminares para su manejo. CECyT-CIAD, 2003 – 2005.
• Participación: Diseño e implementación de un catálogo electrónico para la identificación taxonómica y bioquímica de los peces del Golfo de California. CONACyT-L0083-T, 1997 – 2003.
• Asesor externo: Consolidación y sistematización de las colecciones de referencia de peces y mamíferos del ITESM-Campus Guaymas. CONABIO, enero 1995 a diciembre 1996.
• Responsable: Genética y Taxonomía de los robalos (Centropomus spp.) del Golfo de California, México. CONABIO, 1995 – 1999.
• Responsable: Formación del Laboratorio de Ictiología y Genética de Peces de la Unidad Mazatlán en Acuicultura y Manejo Ambiental del CIAD, A.C. CONACyT, aprobado pero sin alcanzar financiamiento, 1995.
• Responsible: Creación del Museo Regional de Historia Natural Estero del Yugo, CIAD, Ducks Unlimited, 1994 – 2010.
• Responsable: Contribución al conocimiento (taxonomía, biología y ecología) de las comunidades de peces asociados a los fondos blandos de la plataforma continental del Golfo de California. CIAD Proyecto No. 6272, 1994 – 1997.
• Co-investigador principal: Formación de una base de datos de la biodiversidad de fauna marina y costera en el Golfo de California. CONABIO, CI, PRONATURA y CIAD, 1994 – 1997.
• Responsable: Consolidación de la colección de referencia de peces de la Estación Mazatlán (ICMyL-UNAM) e implementación de los mecanismos para su manejo y consulta. CONABIO, 1993 – 1994.
• Participación: Ecología de manglares. Productividad acuática y perfil de comunidades en ecosistemas lagunares-estuarinos de la costa noroccidental de México. Parte 1: Ensenada de Pabellón, Bahía de Altata y Bahía de Mazatlán. DGAPA Clave:IN-202389, 1991.
• Responsable en el ICMyL-UNAM: Fundamentos para la reestructuración de las pesquerias demersales del Pacífico Mexicano. Dirección General XII de la COMUNIDAD ECONÓMICA EUROPEA, 1990 – 1992.
• Responsable: Crianza de recien nacidos de la tortuga marina Lepidochelys olivacea en estanques de concreto (ubicados en la Estación Mazatlán). SEDUE-UNAM, enero – abril, 1990.
• Responsable: Conservación de la tortuga golfina en el litoral de Sinaloa. SEDUE-UNAM, julio – diciembre, 1988.
• Responsable: Eficiencia de distintas pinturas antivegetativas aplicadas en la obra viva del B/O “El Puma” del Instituto de Ciencias del Mar y Limnología – UNAM, noviembre 1986 a enero 1988.
• Participación: Inventario del Golfo de California, México, en relación con la importancia ecológica de los conjuntos macrofaunísticos de la plataforma continental y de las comunidades planctónicas. CONACyT-UNAM, 1986.
• Participación: Estudio Integral de la Bahía de Mazatlán, Sin. CONACyT-PCMANAL 790001, 1980.

• Laura Adriana Vázquez Cureño. Contribución al estudio faunístico y zoogeográfico de los crustáceos decápodos de las zonas rocosas intermareales del sureste del Golfo de California. Universidad Autónoma de Guadalajara, Escuela de Biología. Febrero de 1984 a mayo de 1985. Asesor.
• Carlos Escobar Nataren. Estudio de los macro-invertebrados Polychaeta y Echinodermata de la Laguna de Barra de Navidad, Jalisco. Universidad Autónoma de Guadalajara, Escuela de Biología. Julio de 1983 a diciembre de 1984. Asesor.
• Dora Patricia Sánchez Vargas. Estudio de los moluscos y crustáceos decápodos de la Ensenada de Puerto Viejo, Mazatlán, Sinaloa. Universidad Autónoma de Guadalajara, Escuela de Biología. Agosto de 1982 a marzo de 1984. Asesor.
• Patricia Meiszner Mendel. Contribución al estudio de la fauna de playas arenosas en el área de Mazatlán, Sinaloa. Universidad Autónoma de Guadalajara, Escuela de Biología. Octubre de 1982 a mayo de 1984. Asesor.
• José Salgado Barragan. Contribución al estudio de los estomatópodos del Golfo de California; taxonomía y distribución de las especies. UNAM, Facultad de Ciencias. Diciembre de 1983 a diciembre de 1984. Asesor.
• Yolanda Chavez Zaragoza. Ecología y fisiología de crustáceos decápodos en la zona intermareal rocosa de Punta de Chile, Mazatlán, Sinaloa. Universidad Autónoma de Guadalajara, Escuela de Biología. 1984. Asesor.
• José Luis Arreguin Romero. Estudio de los moluscos de la zona rocosa litoral de la Bahía de Mazatlán, con referencia especial a su zonación. Universidad Autónoma de Guadalajara, Escuela de Biología. Agosto de 1983. Director.
• Edgar Arturo Cubero Gómez. Distribución y zonación de los crustáceos decápodos de la zona litoral rocosa de la Bahía de Mazatlán, Sinaloa. Universidad Autónoma de Guadalajara, Escuela de Biología. Febrero de 1983. Co-Director.
• Miriam Cristina Alvarez del Castillo Cueto. Estudio de la fauna de los crustáceos decápodos del ambiente rocoso, en la Laguna de Barra de Navidad, Jalisco. Universidad Autónoma de Guadalajara, Escuela de Biología. 1983. Co-Director.
• Mauricio Javier Blanco Carranza. Contribución al estudio de las comunidades bentónicas (moluscos y crustáceos decápodos) de la Laguna costera de Agua Brava, Nayarit, México. Universidad Autónoma de Guadalajara, Escuela de Biología. 1983. Asesor.
• Mario David Delgado Vélez. Inicio de la Colección Zoológica de Referencia Clases Elasmobranchii y Teleostomi. Universidad Autónoma de Sinaloa, Escuela Ciencias del Mar. 1983. Asesor.
• Marco Leopoldo Orozco Romo. Estudio del macrobentos de la Bahía de Mazatlán, Sinaloa (con referencia especial a peces, equinodermos, crustaceos y moluscos, en relación con temperatura, salinidad, profundidad y tipo de sustrato). Universidad Autónoma de Guadalajara, Escuela de Biología. 1980. Director.
• Risasi Ongondjo Walo Yuma. Identification et lutte phytosanitaire des insectes parasites du tabac dans les plantations de la Bat – Zaire, Secteur de Bunia. Université Nacionale du Zaire, Institut Supérieur d’Etudes Agronomiques, Bengamisa, Haut-Zaire. Ingeniero Agrónomo. Agosto de 1978. Director.