Dr. Juan Carlos Ramírez Suárez
Dra. Adriana Muhlia Almazán
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Investigador Titular D
Sistema Nacional de Investigadores Nivel 2
Información de Contacto:
Laboratorio Bioenergética y Genética Molecular
Coordinación de Tecnología de Alimentos de Origen Animal
Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo A.C
Carretera a la Victoria Km 0.6, Col La Victoria, CP 83000
Hermosillo, Sonora, Mexico
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Teléfono: 52 (662) 2 89 24 00 ext 504
Fax: 52 (662) 2 80 04 21
Estudios
Posdoctorado: Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo A.C.
Doctorado: Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste (CIBNOR, 2005)
Líneas de Interes en Investigación:
- Estudio de la Bioenergética mitocondrial
- Genética molecular del camarón
- Estudio de enzimas digestivas del camarón
Publicaciones selectas 2012-2015
- Stephens, A., Rojo, L., Araujo-Bernal, S., Garcia-Carreño, F. and Muhlia-Almazan, A. 2012. Cathepsin B from the shite shrimp Litopenaeus vannamei: cDNA sequence analysis, tissue-specific expression and its biological activity. Comparative Biochemistry and Physiology. PartB. 161:32-40.
- Sánchez-Paz, A. Sotelo-Mundo, R. and Muhlia-Almazán, A. 2012.The Challenges of Developing a Treatment that fully Protects Shrimp against WSSV Infection: a perspective. In: Advances in Zoology Research. (Ed). Jenkins, O. Vol. 1. NOVA Science Publishers. Pp. 1-30. ISBN: 978-1-61470-960-2.
- Martinez-Cruz, O.; Sanchez-Paz, J.A., Garcia-Carreño, F.L., Jimenez-Gutierrez, L.R., Navarrete del Toro, M.A. and Muhlia-Almazan, A. 2012. Invertebrates Mitochondrial Function and Energetic Challenges. In: 218ISBN 978-953-51-0090-4, pp. 181-218.
- Garcia-Orozco, K., Sanchez-Paz, A., Aispuro-Hernandez, E., Gomez-Jimenez, S., Lopez-Zavala, A., Araujo-Bernal, S. and Muhlia-Almazan, A. 2012. Gene expression and protein levels of thioredoxin in the gills from the whiteleg shrimp Litopenaeus vannamei infected with two different virus: the WSSV or IHHNV. Fish and Shellfish Immunology. 32(6):1141-1147.
- Martinez-Cruz, O., Calderon de la Barca, A.M., Uribe-Carbajal, S. and Muhlia-Almazan, A. 2012. The function of mitocondrial FoF1 ATP-synthase function from the whiteleg shrimp Litopenaeus vannamei during hipoxia. Comparative Biochemistry and Physiology, part B. 162(4): 107-112.
- Jimenez-Gutierrez, L.R, Uribe-Carvajal, S., Sanchez-Paz, A., Chimeo, C., and Muhlia-Almazán, A. 2014 .The cytochrome c oxidase and its mitochondrial function in the whiteleg shrimp Litopenaeus vannamei during hypoxia. Journal of Bioenergetics and Biomembranes. 46(3): 189-196.
- García-Carreño F.L., Navarrete del Toro M.A., Muhlia-Almazán A. 2014. The role of Lysosomal cysteine proteases in crustaceans immune response. Invertebrate Survival Journal. 11: 109-118.
- Sanchez-Paz, A., Muhlia-Almazan, A., Saborowski R, García-Carreño F, Mendoza-Cano F. 2014. Marine viruses: the beneficial side of a threat. Applied Biochemistry and Biotechnology. 174: 2368-2379.
- Martinez-Cruz, O., Arvizu-Flores, A., Sotelo-Mundo, R., Muhlia-Almazán, A. 2015. The nuclear encoded subunits gamma, delta and epsilon from the shrimp mitochondrial F1-ATP synthase, and their transcriptional response during hypoxia. Journal of Bioenergetics and Biomembranes. 47: 225-234.
- Stephens-Camacho N.A., Muhlia-Almazan A., Sánchez-Paz J.A., Rosas-Rodriguez JA. 2015. Surviving environmental stress: The role of betaine aldehyde dehydrogenase in marine crustacens. Aceptado. On line.
Capitulos de Libro
- Sánchez-Paz, A. Sotelo-Mundo, R. and Muhlia-Almazán, A. 2012.The Challenges of Developing a Treatment that fully Protects Shrimp against WSSV Infection: a perspective. In: Advances in Zoology Research. (Ed). Jenkins, O.P. Vol. 1. NOVA Science Publishers. Pp. 1-30. ISBN: 978-1-61470-960-2.
- Martinez-Cruz, O.; Sanchez-Paz, J.A., Garcia-Carreño, F.L., Jimenez-Gutierrez, L.R., Navarrete del Toro, M.A. and Muhlia-Almazan, A. 2012. Invertebrates Mitochondrial Function and Energetic Challenges. In: 218ISBN 978-953-51-0090-4, pp. 181-218.
GRUPO DE TRABAJO
El laboratorio de la Dra. Muhlia esta enfocado en el estudio del metabolismo energético del camarón, en particular, se estudia la función mitocondrial incluyendo su fisiología, sus proteínas y genes, y el efecto que provoca en los organismos la reducción en el nivel de oxígeno disuelto o hipoxia.
Actualmente se cuenta con dos proyectos vigentes:
- Bioenergética y regulación de la función respiratoria de las mitocondrias del camarón. (Apoyo CONACyT Ciencia Básica. 241670, Convocatoria 2015).
- Las proteinasas ácidas digestivas e intracelulares de crustáceos. (Apoyo CONACyT Ciencia Básica.177954, Convocatoria 2012).
Colaboradores:
Q.B. Sandra Ruth Araujo L.
Técnico Académico
Químico Biólogo. Universidad de Sonora, 1996.
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Estudiantes:
- M.C. Cindy Chimeo Nuñez. Estudiante de Doctorado. Programa CIAD. En proceso.
- M.C. Chrystian Mariana Rodríguez Armenta. Estudiante de Doctorado. Programa CIAD. En proceso.
- M.C. Claudia Ivette Maytorena. Estudiante de Doctorado. Programa CIBNOR. Codirección CIBNOR-CIAD. En proceso.
- IB. Ofelia Alejandra Méndez Romero. Estudiante de Maestría. Programa CIAD. En proceso.
- Kathia Ramírez Armenta. Estudiante de Licenciatura. Universidad de Sonora. En proceso.
Tesis dirigidas recientes
- Priscila Arámbula. Evaluación del efecto de la infección con IHHNV en la expresión del gen de tiorredoxina en las branquias del camarón blanco Litopenaeus vannamei. Ingeniero Bioctecnólogo. Institituto Tecnológico de Sonora. Febrero de 2011.
- Oliviert Martínez Cruz. Titulo de la Tesis: Expresión génica de las subunidades ATP6 mitocondrial y ATPc nuclear de ATP-sintasa en Litopenaeus vannamei sometidos a hipoxia. Maestría en Ciencias, CIAD. Noviembre, 2003
- Oliviert Martínez Cruz.Estudio de la porción catalítica F1 de la ATP sintasa del camarón blanco (Litopenaeus vannamei): sus genes, proteínas y su respuesta frente a la hipoxia. Doctorado en Ciencias, CIAD. Diciembre de 2011
Afiliaciones o sociedades científicas
Miembro de la Sociedad Mexicana de Biotecnología y Bioingeniería, A.C. Desde 2001.
Socio numerario de la Sociedad Mexicana de Bioquimica. Desde 2004.
Miembro de la PanAmerican Marine Biotechnology Association desde 2004.
Miembro Nivel 1 del Sistema Nacional de Investigadores de CONACYT. A partir de 2008.
Miembro del Comité Ejecutivo del Capitulo Mexico del “The Third World Organization for Women in Science (TWOWS). Dese Septiembre, 2007.
Miembro Acreditado CONACyT RCEA-06-16099-2008.
Cursos que Imparte
- Fisiologia Animal Comparada
Investigador Titular E, SNI III
Dirección: Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo, A.C.
Carretera a la Victoria Km. 0.6, Hermosillo, Sonora, México
C.P. 83304, Apdo. Postal # 1735.
Teléfono: +52 (662) 289-24-00, ext. 352
Fax: +52 (662) 280-04-21
E-mail: Esta dirección de correo electrónico está siendo protegida contra los robots de spam. Necesita tener JavaScript habilitado para poder verlo.
Twitter: @rogeriosotelo
Página Personal: https://www.researchgate.net/profile/Rogerio_Sotelo-Mundo/
Estudios
Licenciatura: Ingeniería Industrial Química, Instituto Tecnológico de Chihuahua 1987. Chihuahua, Chihuahua.
Maestría: Maestría en Ciencias, con especialidad en Nutrición y Alimentos. Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo, A.C. 1993. Hermosillo, Sonora.
Doctorado: Doctorado en Bioquímica. Departamento de Bioquímica, Universidad de Arizona, Tucson AZ EEU, 1999
Líneas de Investigación
Nuestro grupo, el Laboratorio de Estructura Biomolecular, se dedica en entender a escala molecular y atómica la relación entre la estructura y función de proteínas con compuestos bioactivos, metabolitos, nucleótidos y moléculas sintéticas biomiméticas.
Utilizamos como herramienta básica la producción de proteínas recombinantes derivados de estudios genómicos, transcriptómicos o metagenómicos. Posteriormente utilizamos herramientas bioquímicas y biofísicas para caracterizarlas y para estudiar su estructura las llevamos al estado sólido mediante cristalización.
Los cristales pudeden ser analizdos en un difractómetro de rayos X para monocristales disponible en CIAD o en fuentes de luz sincrotrónica como el Sincrotrón de la Universidad de Stanford (Stanford Synchrotron Radiation Lightsource, SSRL) o el National Synchrotron Light Source II (NSLS-II) del Laboratorio Nacional de Brookhaven. Pertenecemos a la Red Temática de Usuarios de Luz Sincrotrón (REDTULS) lo que nos permite el acceso y apoyo a colaboraciones internacionales.
En un proyecto con financiameinto de CONACYT, realizamos un estudio comparativo de genomas para identificar proteínas únicas de una cepa bacteriana patógena para el camarón. Esas proteínas se están estudiando bioquímica y cristalográficamente. Colaboramos con investigadores que sintetizan moléculas con actividades biomiméticas y con reconocimiento supramolecular, aportando el componente estructural a sus investigaciónes. A la fecha se han doctorado 11 estudiantes de doctorado en el grupo en tematicas afines.
Existen oportunidades de tesis en el tema a nivel doctorado, maestría y licenciatura. También estamos interesados en recibir postdoctorantes interesados en cristalografía y bioquímica estructural.
Las aptitudes que buscamos en los miembros del equipo son sólidas bases en bioquímica, química, fisicoquímica, biología, microbiología y un nivel intermedio-avanzado del idioma inglés. La capacidad de lectura y comprensión de textos es también muy importante. Las actitudes que buscamos son dedicacíon exclusiva y de tiempo completo, capacidad de trabajar en equipo y interés en desarrollar habilidades analíticas. Dado que los proyectos son de largo aliento, es importante poder dar seguimento contínuo a protocolos experimentales por semanas o meses.
Personas interesadas en estudios de doctorado y estancias postdoctorales en temas de bioquímica, estructura de proteínas, cristalografía y producción de proteínas recombinantes, enviar correo electrónico a: Esta dirección de correo electrónico está siendo protegida contra los robots de spam. Necesita tener JavaScript habilitado para poder verlo..
Interesados en tesis de licenciatura y maestría en los temas anteriores, enviar correo electrónico a: Esta dirección de correo electrónico está siendo protegida contra los robots de spam. Necesita tener JavaScript habilitado para poder verlo..
RESUMEN CURRIULAR:
Publicaciones totales indizadas: 98 totales, 96 en Scopus, 92 en Scitation Index (ISI-JCR), 42 como autor corresponsal. 4 capítulos de libro.
Estudiantes graduados: 12 doctorado (tres en codirección), 13 maestría, 5 licenciatura
Formación de investigadores: 6 postdoctorantes y 2 profesor en estancia sabática.
INDICE H=19 JCR, INDICE H=18 Scopus (sin autocitas de todos los autores), 1,088 citas sin autocitas de todos los autores (Scopus)
Research ID A-6097-2011
ORCID 0000-0001-5543-6889
Scopus Author ID: 6602179004
Publicaciones Recientes:
- Viviana Calvillo-Páez, Rogerio R. Sotelo-Mundo, Raymundo Escobar-Picos, Mario Leyva-Peralta, Juan Carlos Gálvez-Ruiz, David Corona-Martínez, Ramón Moreno-Corral, Octavio Juárez-Sánchez, Herbert Höpfl and Karen Ochoa-Lara* (2018) Synthesis, spectroscopic, physicochemical and structural characterization of new tetrandrine-based macrocycles: DNA binding and antiproliferative activity. Chemico-Biological Interactions 286(1):34-44.
https://doi.org/10.1016/j.cbi.2018.02.013 - Raúl J. Bobes, José Navarrete-Perea, Adrián Ochoa-Leyva, Víctor Hugo Anaya, Marisela Hernández, Jacquelynne Cervantes-Torres, Karel Estrada, Filiberto Sánchez-Lopez, Xavier Soberón, Gabriela Rosas, Cáris Maroni Nunes, Martín García-Varela, Rogerio Rafael Sotelo-Mundo, Alonso Alexis López-Zavala, Goar Gevorkian, Gonzalo Acero, Juan P. Laclette, Gladis Fragoso, Edda Sciutto* (2017) Experimental and theoretical approaches to investigate the immunogenicity of Taenia solium-derived KE7 antigen. Infection and Immunity 85(12):e00395-17.
http://dx.doi.org/10.1128/IAI.00395-17 - Aldana Laino, Alonso A. Lopez-Zavala, Karina D. Garcia-Orozco, Jesus S. Carrasco-Miranda, Marianela Santana, Vivian Stojanoff, Rogerio R. Sotelo-Mundo*, Carlos Fernando Garcia* (2017) Biochemical and structural characterization of a novel arginine kinase from the spider Polybetes pythagoricus. PeerJ 5:e3787.
http://dx.doi.org/10.7717/peerj.3787 - Adam A. Campos-Acevedo,* Javier Pérez, Rogerio R. Sotelo-Mundo and Enrique Rudiño-Piñera* (2017) Is dimerization a common feature in Thioredoxins?: the case of Thioredoxin from Litopenaeus vannamei. Acta Crystallographica D. D73(4):326-339.
https://doi.org/10.1107/S2059798317002066 - Ignacio Valenzuela-Chavira, Carmen A. Contreras-Vergara*, Aldo A. Arvizu-Flores, Hugo Serrano-Posada, Alonso A. Lopez-Zavala, Karina D. García-Orozco, Javier Hernandez-Paredes, Enrique Rudiño-Piñera, Vivian Stojanoff, Rogerio R. Sotelo-Mundo*, Maria A. Islas-Osuna (2017) Insights into ligand binding to a Glutathione S-transferase from mango: structure, thermodynamics and kinetics. Biochimie, 135:35-45.
https://doi.org/10.1016/j.biochi.2017.01.005 - Luis Miguel López-Martínez, Hisila Santacruz-Ortega*, Rosa Elena Navarro, Motomichi Inoue, Rocío Sugich-Miranda, Javier Hernández-Paredes, Ivan Castillo, Rogerio R. Sotelo-Mundo* (2017) Synthesis and characterization of a 13-member macrocycle functionalized by tyramine arms: complexation with Cu2+ and antioxidant capacity. Polyhedron 127(1):438-448.
https://doi.org/10.1016/j.poly.2016.10.028 - Alonso A. Lopez-Zavala, Jesus S. Carrasco-Miranda, Claudia D. Ramirez-Aguirre, Marisol López-Hidalgo, Claudia G. Benitez-Cardoza, Adrian Ochoa-Leyva, Cesar S. Cardona-Felix, Corina Diaz-Quezada, Enrique Rudiño-Piñera, Rogerio R. Sotelo-Mundo*, Luis G. Brieba* (2016) Structural insights from a novel invertebrate triosephosphate isomerase from Litopenaeus vannamei. Biochimica et Biophysica Acta 1864(12):1696–1706
https://doi.org/10.1016/j.bbapap.2016.09.002 - Eduardo Guevara-Hernandez, Aldo A. Arvizu-Flores*, Maria E. Lugo-Sanchez, Enrique F. Velazquez-Contreras, Francisco J. Castillo-Yañez, Luis G. Brieba,Rogerio R. Sotelo-Mundo* (2015) A novel viral thymidylate kinase with dual kinase activity.Journal of Bioenergetics and Biomembranes 47(5):431-440.
https://doi.org/10.1007/s10863-015-9622-z
Profesora investigadora Titular E, SNI III, miembro AMC
CIAD-Hermosillo
Dirección: Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo, A.C.
Carretera a la Victoria Km. 0.6 AP 1735. Hermosillo, Sonora, México C.P. 83304
Teléfono: (662) 289-2400 Ext 350, Lab 391
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Estudios
Postdoctorado: Universidad de Arizona, Arizona Research Laboratories, Tucson, AZ, U.S.A., 1991
Doctorado: Bioquímica, Departamento de Bioquímica, Universidad de Arizona, Tucson AZ, U.S.A., 1990.
Licenciatura: Químico-Biólogo, Escuela de Ciencias Química, Universidad de Sonora, Hermosillo, Sonora, 1983
Líneas de Investigación
- Genes y proteínas de vías centrales de utilización de energía
- Respuesta al estrés por hipoxia y por la inducción de metabolismo anaerobio
- Regulación y genes de proteínas antioxidantes
Los trabajos en caracterización de genes y proteínas del camarón son temas centrales en nuestro laboratorio desde hace tiempo y se enfocan al camarón blanco del Pacífico Litopenaeus vannamei por su interesante biología y bioquímica, así como por su importancia para la camaronicultura, que es una fuente importante de divisas para el Noroeste de México.
Durante la respuesta al estrés se generan especies reactivas de oxígeno (ROS) que al acumularse ocasionan daño celular y genético, por lo que estudiamos las enzimas antioxidantes responsables de su degradación en respuesta al estrés oxidativo. Los trabajos más recientes se dirigen a entender los efectos de la hipoxia y reoxigenación en camarón, porque este crustáceo es capaz de sobrevivir con poco oxígeno por tiempos considerables, pero aún no se conocen bien los procesos, mecanismos o adaptaciones que para ello utiliza.
Por otro lado, durante la hipoxia se activa la glucólisis anaerobia. Por ello, estamos estudiando proteínas del metabolismo central energético, particularmente los de la primera parte del metabolismo de carbohidratos (glucólisis y transporte de glucosa) y su regulación mediada por el factor de transcripción HIF-1. Asimismo, durante la hipoxia en vertebrados, se presenta apoptosis, que también estamos estudiando por su relación al factor de transcripción p53 y su interacción con HIF-1.
Personas interesadas en estudios de posgrado y estancias postdoctorales, enviar correo electrónico a: Esta dirección de correo electrónico está siendo protegida contra los robots de spam. Necesita tener JavaScript habilitado para poder verlo.
Publicaciones totales en Scopus: 100
Research gate: www.researchgate.net/profile/Gloria_Yepiz-Plascencia/publications
Google scholar: https://scholar.google.com.mx/citations?hl=en&user=qBiobA4AAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
Indice H=25 (Scopus, junio 2018)
Publicaciones recientes seleccionadas
- Camacho-Jiménez L., Peregrino-Uriarte AB, Martínez-Quintana JA, Yepiz-Plascencia G. 2018. The glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase of the shrimp Litopenaeus vannamei: Molecular cloning, characterization and expression during hypoxia. Marine and Environmental Research. 138: 65-75.
- Hernández-Palomares MLE, Godoy-Lugo JA, Gómez-Jiménez S, Gámez-Alejo LA, Ortiz RM, Muñoz-Valle JF, Peregrino-Uriarte AB, Yepiz-Plascencia G, Rosas-Rodríguez JA, Soñanez-Organis JG. 2018. Regulation of lactate dehydrogenase in response to WSSV infection in the shrimp Litopenaeus vannamei. Fish & Shellfish Immunology. 74: 401–409.
- Núñez Hernández DM, Felix Portillo M, Peregrino Uriarte AB, Yepiz Plascencia GM. 2018. Cell cycle regulation and apoptosis mediated by p53 in response to hypoxia in hepatopancreas of the white shrimp L. vannamei. Chemosphere. 190:253-259.
- Fregoso-Peñuñuri A, Valenzuela-Soto EM, Figueroa-Soto CG, Peregrino-Uriarte AB, Ochoa-Valdez MJ, Leyva-Carrillo L, Yepiz-Plascencia G. 2017. White shrimp Litopenaeus vannamei recombinant lactate dehydrogenase: Biochemical and kinetic characterization. Protein Expression and Purification. 137:20-25
- Felix-Portilo M., Martínez-Quintana JA, Arenas-Padilla, M., Mata-Haro V., Gómez-Jiménez S., Yepiz-Plascencia G. 2016. Hypoxia drives apoptosis independently of p53 and metallothionein transcript levels in hemocytes of the whiteleg shrimp Litopenaeus vannamei. Chemosphere. 161: 454-462
- Martínez-Quintana JA, Valenzuela-Soto EM, Martínez-Téllez MA, Peregrino-Uriarte AB, Gómez-Jiménez S, Kikuta S, Yepiz-Plascencia G. 2016. Functionality of the white shrimp glucose transporter 1: Expression in Xenopus oocytes and gene silencing during hypoxia. Journal of Experimental Marine Biology and Ecology. 474:109-115
- Cota-Ruiz AK, Leyva-Carrillo L, Peregrino-Uriarte AB, Valenzuela-Soto EM, Gollas-Galván T, Gómez-Jiménez S, Hernández-López J, Yepiz-Plascencia G. 2016. Role of HIF-1 on phosphofructokinase and fructose 1, 6-bisphosphatase expression during hypoxia in the shrimp L. vannamei. Comparative Biochemistry & Physiology Part A. 198:1.
- García-Triana A, Peregrino-Uriarte AB, Yepiz-Plascencia G. 2016. Selenoprotein M gene expression, peroxidases activity and hydrogen peroxide concentration are differentially regulated in gill and hepatopancreas of the white shrimp L. vannamei during hypoxia and reoxygenation. Comparative Biochemistry & Physiology, Part A. 199:14-20.
- Martínez-Quintana JA, Peregrino-Uriarte AB, Cota-Ruiz AK, Félix-Portillo M, Yepiz-Plascencia G. 2015. Expression of fructose 1,6-bisphosphatase and phosphofructokinase is induced in hepatopancreas of the white shrimp Litopenaeus vannamei by hypoxia. Marine and Environmental Research. 106:1-9
- Martíne-Quintana JA, Peregrino-Uriarte A.B, Félix-Portillo M, Kikuta S, Yepiz-Plascencia G. 2015. A novel functional glucose transporter in the shrimp L. vannamei -LvGLUT2- is up-regulated during hypoxia in hepatopancreas. Marine&Environmental Research. 112:1-67.
- Martínez-Quintana JA, Peregrino-Uriarte AB, Gollas-Galván T, Gómez-Jiménez S and Yepiz-Plascencia G. 2014. The glucose transporter 1 -GLUT1- from the white shrimp L. vannamei is up-regulated during hipoxia. Molecular Biology Reports. 41:7885–7898.
- Felix-Portillo M, Martinez-Quintana JA, Peregrino-Uriarte AB and Yepiz-Plascencia G. 2014. The metallothionein gene from the white shrimp L. vannamei: Characterization and expression in response to hypoxia. Marine Environmental Research 101 (2014) 91-100.
Formación de Recursos Humanos
Doctorado: 11 terminados, 3 en proceso
Maestría: 18 terminados, 1 en proceso
Licenciatura: 7 titulados
Son bienvenidos estudiantes interesados en los programas de posgrado
