El objetivo de esta Dirección es realizar investigación en dos áreas muy bien definidas: nutrición humana y nutrición animal. Las líneas de investigación en el área de nutrición humana son: parasitología, epidemiología de la nutrición, composición y valor nutritivo de los alimentos, metabolismo de minerales, bioquímica nutricional, metabolismo energético y composición corporal, fisiología del ejercicio y nutrición del deportista, relación de la genética y medio ambiente en la patogénesis de diabetes y obesidad. El área de nutrición animal desarrolla proyectos de investigación relacionados con el mejoramiento de la industria avícola, porcícola y de rumiantes. La planta académica de la Dirección de Nutrición está integrada por 9 doctores y 3 maestros en ciencias.

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